Gambaran Istilah Satelit DNA Dan Perbedaan Antara Satelit, Minisatelit, Dan Microsatelit
Nama: Aditya Christie W
NIM: B1J006173
Kelas: A1
Email: aditchristie@gmail.com
Blog: http://aditfabio06.wordpress.com
Topik: A1-AG11
RINGKASAN
DNA Satelit
Urutan berulang-ulang DNA merupakan sebuak gambaran umum dari genom eukaryote tetapi juga ditemukan dalam prokaryot dengan frekuensi yang lebih sedikit. Tipe berulang yang seperti ini dinamakan DNA Satelit karena fragmen-fragmen DNA yang berisi urutan berulang dari kelompok “Satelit” ketika genom DNA terpecah karena kepadatan gradient sentrifugasi. Kelompok satelit berisi fragmen-fragmen DNA yang berulang dan mempunyai kandungan GC.
Gambar DNA Satelit manusia (*)
DNA Satelit ditemukan dalam sentromer dan juga di tempat lain dalam kromosom eukaryot. Sebuah genom dapat berisi beberapa tipe DNA Satelit yabg berbeda-beda, setiap Satelit dengan sebuah perbedaan unit yang berulang-ulang, unit tersebut berkisar antara 5-200 bp. Tiga kelompok Satelit dalam DNA manusia meliputi 4 perbedaan dari tipe berulang. Salah satu tipe DNA Satelit yang ditemukan dalam manusia adalah alphoid DNA yang berulang, terdapat di bagian sentromer dalam kromosom.
Minisatelit dan Mikrosatelit
Minisatelit dan Mikrosatelit merupakan dua tipe lain dari DNA Satelit, walaupun keduanya tidak muncul dalam kelompok-kelompok satelit pada gradient kepadatan. Minisatelit berbentuk seperti ikatan-ikatan yang memiliki panjang hingga 20 kb, dengan unit yang berulang mencapai 25 bp. Ikatan-ikatan mikrosatelit sangat pendek, biasanya kurang dari 150 bp dengan mempunyai unit yang berulang biasanya 13 bp atau dibawahnya. Minisatelit merupakan tipe kedua dari DNA berulang. Telomerik DNA yang ada di dalam manusia meliputi ratusan kopi dari motif 5’-TTAGGG-3’ adalah salah satu contoh dari sebuah Minisatelit.
Lokasi mikrosatelit dalam lengan pendek kromosom 6 telah diperbesar dengan PCR. Hasil dari PCR ditandai dengan warna yang berbeda. Setiap garis menunjukan profil genetik dari individu yang berbeda. Tidak ada dua orang yang memiliki profil genetik yang sama karena setiap orang mempunyai perbedaan mikrosatelit yang bervariasi.
Fungsi dari Mikrosatelit masih misterius. Tipe Mikrosatelit tetap yaitu 1-, 2-, 3-, atau 4- bp unit yang berulang 10-20 kali. sebagai contoh adalah Mikrosatelit yang ada di dalam reseptor sel-T β dalam manusia. Walaupun setiap Mikrosatelit relatif pendek, tetapi ada beberapa mikrosatelit dalam sebuah genom.
Contoh :
Mikrosatelit dengan CA berulang
5’-CACACACACACACAC-3’
3’-GTGTGTGTGTGTGTG-5’
0,25% dalam genom.
Basa tunggal berulang
5’-AAAAAAAAAAAAAA-3’
3’-TTTTTTTTTTTTTTTT-5’
0,15% dalam genom.
Gambaran mikrosatelit
Daftar Pustaka
Brown, T.A (2002) DNA in Genomes, 2nd ed.,
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?rid=genomes.section.5234
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?rid=genomes.section.5545
diakses tanggal 25 September 2008
Situs Terkait
1. http://www.humangenom.hu/uploads/images/Chrom_fig2.jpg
2. http://www.blackwellpublishing.com/korfgenetics/figure.asp?chap=06&fig=Fig6-9
3. http://www.afsc.noaa.gov/ABL/MESA/mesa_sa_pp_ss.htm
4. http://www.people.eku.edu/richters/lab/images/cynthia1.jpg
5. http://www.nature.com/emboj/journal/v17/n14/full/7591114a.html
diakses tanggal 26 September 2008
